Program Pascasarjana sebagai salah satu unit kerja di bawah naungan Universitas Iskandar Muda (UNIDA), dengan ijin penyelenggaraan dari Dirjen Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional Nomor: 67/E/O/2014 tanggal 7 Mei 2014 dengan memiliki satu Program Studi Ilmu Administrasi (S2). UNIDA merupakan Universitas yang didirikan pada tanggal 25 Februari 1987 oleh Yayasan Iskandar Muda yang merupakan badan penyelenggara UNIDA. Universitas Iskandar Muda tercatat sebagai salah satu Universitas tertua di Aceh dan dalam usianya saat ini, UNIDA telah berkembang cukup pesat seiring dengan dinamika perkembangan dunia Pendidikan di Indonesia. Sebagai salah satu insitusi Pendidikan Tinggi, tentunya UNIDA dituntut untuk selalu berperan aktif dalam menghasilkan lulusan dengan kualitas memiliki kemampuan mengatasi permasalahan-permasalahan global. Program Pascasarjana Universitas Iskandar Muda (PPs UNIDA) saat ini mengelola satu Program Studi yaitu Program Studi Magister Ilmu Administrasi. Program Studi Magister Ilmu Administrasi telah terakreditasi B berdasarkan SK Nomor: 0870/SK/BAN-PT/Akred/M/VI/2026.
Semenjak Tahun 2020 berdasarkan SK Menteri Pendidikan kebudayaan RI dengan Nomor: 175/M/2020 nama Program Studi di lingkungan Program Pascasarjana menyesuaikan nomenklatur tentang nama-nama Program Studi. Sehingga Nama Program Studi Ilmu Administrasi (S2) menjadi Program Studi Administrasi Publik (S2) telah mengalami perpanjangan dengan mendapat Predikat terakreditasi B dari BAN-PT dengan Nomor 5739/SK/BAN-PT/Ak-PNB/M/VIII/2024.
